У 1986 р. Наказом Міністерства освіти України на базі Київського державного педагогічного інституту ім. О. М. Горького був створений Переяслав-Хмельницький філіал з двома факультетами: фізичного виховання і підготовки вчителів молодших класів. На останньому була створена кафедра природознавства. Першим завідувачем кафедри було призначено Віталія Васильовича Купцова – кандидата медичних наук, доцента, Заслуженого працівника охорони здоров’я України. 3 травня 1988 р. на кафедру природознавства Переяслав-Хмельницького філіалу КДПІ ім. О. М. Горького на посаду доцента був прийнятий Борис Олексійович Чернов, який у квітні 1990 року був обраний за конкурсом завідувачем кафедри. Борис Олексійович Чернов – кандидат педагогічних наук, професор, Відмінник освіти України очолював кафедру до 2020 року.
14 березня 2002 р. наказом Міністерства освіти і науки України Переяслав-Хмельницький державний педагогічний інститут ім. Г. С. Сковороди був реорганізований у ДВНЗ «Переяслав-Хмельницький державний педагогічний університет імені Григорія Сковороди». У 2003 р. з метою приведення у відповідність структурних підрозділів університету та у зв’язку з відкриттям нової спеціальності «Педагогіка і методика середньої освіти. Географія» був створений природничо-географічний факультет (декан – Шапран Юрій Петрович), а кафедра була перейменована на кафедру географії і методики навчання природничих дисциплін, а згодом – кафедру географії, екології і методики навчання. З 2006 по 2012 рік кафедра входила до складу Інституту фізичного виховання та природознавства (декан – доктор історичних наук, професор Куйбіда Віктор Віталійович), з 2012 по 2020 рік – до складу природничо-технологічного факультету (декан – доктор історичних наук, професор Гончаренко Олексій Миколайович). З 2020 року кафедра була невід’ємною частиною новоствореного факультету гуманітарно-природничої освіти і соціальних технологій Університету Григорія Сковороди в Переяславі (декан – кандидат історичних наук, доцент Редзюк Вячеслав Володимирович). У 2021 році наказом Міністерства освіти і науки України ДВНЗ «Переяслав-Хмельницький державний педагогічний університет імені Григорія Сковороди» перейменовано в Університет Григорія Сковороди в Переяславі. З 2023 року кафедру перейменовано у кафедру екології, географії і методики навчання та включено до складу факультету природничої освіти (декан – кандидат історичних наук Юрій Леонідович Козубенко). Кафедру екології, географії і методики навчання з 2020 року очолює кандидат географічних наук, доцент Людмила Михайлівна Воловик.